Đã một năm kể từ sau khi sự kiện trong Arkham City kết thúc,ógìhấpdẫatletico huila vsthành phố Gotham đang ở trong quá trình phục hồi tổn thất. Cái chết của Jokerđã mở ra một thời đại mới cho Gotham, đã có những dấu hiệu của sự tái sinh. Mặc dù cái ác vẫn còn tồn tại, nhưng việc thiếu vắng bóng hình của gã Joker làm bọn chúng không đủ sức để gây quá nhiều phiền toái cho dân cư Gotham.

Sự vắng mặt của Joker đã tạo nên một cán cân không cân bằng về ánh sáng và bóng tối tại Gotham và Scarecrow – nhân vật phản diện đầu tiên,gây tranh cãi của Rocksteady – đã trở lại. Với những cuộc tấn công hóa học quymô lớn, gã đã đe dọa toàn Gotham, buộc chính quyền phải sơ tán người dân thành phố. Đây là cách mà Batman: Arkham Knight bắt đầu.